===دفاتر گمرکی که زیر نظر گمرک خرمشهر فعالیت مینمایند:===
===*1-بازارچه مرزی خرمشهر====
از اهم فعالیتهای این بازارچه، واردات و صادرات قطعی میباشد که چهارچوب مقررات موجود میتوانند بر اساس سهمیه از پیش تعیین شده توسط وزارت بازرگانی اقدام به صدور کالا نموده و به همان میزان میتوانند کالا وارد نمایند.
===*2-منطقه ویژه اقتصادی خرمشهر===
در این منطقه نیز با توجه به مزیتهای نسبی که در مورد انبارداری کالا به بازرگانان داده میشود در دو زمینه واردات و صادرات قطعی میتوان اقدام به ورود یا صدور کالا نمود.
===*3-منطقه ویژه اقتصادی خوزستان===
فعالیتها و خدمات منطقه ویژه خوزستان گستردهتر از منطقه اقتصادی خرمشهر بوده و علاوه بر واردات و صادرات قطعی، بازرگانان میتوانند اقدام به ورود موقت یا ترانزیت داخلی کالا نمایند.
===*4-گمرک شلمچه===
این گمرک در 15 کیلومتری غرب خرمشهر واقع شده و اهم فعالیتهای خود را در زمینه مسافری، صادرات و واردات قطعی و مرجوعی متمرکز نموده است. در گمرک شلمچه با توجه به اینکه مرز بین ایران و عراق بعد از بازگشایی گردیده و مسافرین محترم به ویژه زوار عتبات عالیات همواره به صورت گسترده اقدام به خروج از کشور مینمایند، امور مسافری گسترش یافته و عمده فعالیت این گمرک را در بر میگیرد.<ref>[http://pedram2020.blogfa.com/post/146 گمرک خرمشهر]</ref>